凝结芽孢杆菌在有氧及无氧的环境下都可成长，能适应低氧的肠道环境，对酸和胆汁有较高的耐受性，可以进行乳酸发酵，发生的L-乳酸能下降肠道pH 值，按捺有害菌，并能促进双歧杆菌等有益菌的成长和繁衍。凝结芽孢杆菌可以构成芽孢，与其他不产乳酸的芽孢杆菌相比有利于恢复胃肠道的微生态平衡。凝结芽孢杆菌芽孢在人体中约4-6h便可萌生，其间85%的菌体可顺利经过消化系统，***总算肠道中萌生并繁衍 。但值得关注的是，凝结芽孢杆菌不同于其它的益生菌，因为菌体在肠道上皮细胞的粘附性较弱，所以在天然条件下一般很难在肠道中存在 。因而，作为肠道内的"移民"，凝结芽孢杆菌只能在肠道内做短暂的停留，一次性口服凝结芽孢杆菌后，经过大约4~7d时刻肠道内的凝结芽孢杆菌便会经过排便而消失殆尽 。所以只要持续服用凝结芽孢杆菌菌剂，才能使得该菌在肠道中充分发挥其益生作用。